构成物质的基本微粒有分子、原子和离子，同时分子、原子、离子都能直接构成物质，通常金属和固态非金属单质是由原子构成的，盐类和碱类等物质是由离子构成的。
分子是由组成的原子按照一定的键合顺序和空间排列而结合在一起的整体，这种键合顺序和空间排列关系称为分子结构，由于分子内原子间的相互作用，分子的物理和化学性质不仅取决于组成原子的种类和数目，更取决于分子的结构。
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