大多数红肉菠萝蜜的果肉是橙红色的，有些红肉菠萝蜜的果肉是大红色，但很少见，有些颜色不明显；黄肉菠萝蜜的果肉是金黄色的，对比两者可以看出区别。

2、不同的水果类型：

红肉菠萝蜜的果形为椭圆形，圆而饱满，大小适中；黄色果肉的菠萝蜜果实形状较长，体积较大。

3、不同的水果产量：

红肉菠萝蜜果实相对圆润饱满，丝少，果实产量相对较高。一般13斤的果实产量高达5-6斤；黄肉菠萝蜜丝多，20斤的产量在4-5斤左右。

4、不同的甜度：

红肉菠萝蜜果肉橙红色，厚而甜脆，香气浓郁，甜度可达25度左右；黄色菠萝蜜的果肉呈金黄色，甜度比红色菠萝蜜轻，甜度只有17度左右。